死因裁判法庭完成宣读2012年南丫岛附近撞船事故罹难者死因裁决。政府表示尊重死因庭裁决，并会仔细研究和认真跟进判辞，同时向死者家属致以最深切慰问。针对死因裁判官给予海事处的建议，海事处会认真研究跟进。

死因裁判官共提出四项建议，其一，与船厂、海上运输服务营运商及相关专业团体定期接触，或透过发出简易指引或澄清，以确保他们了解相关规例的实施方法。海事处回应指，该处已实施本地安全管理系统，以主动风险管理的方针，加强与业界就海上安全相关事宜上的沟通。

其二，实施新制度，要求船东在定期验船前确认船只在上次验船后没有被改装。海事处表示，正积极筹备在目前验船制度下，要求船东在验船前确定船舶没有作未获允许的改装。

其三，继续检视海员的工时和休息安排，尤其专注于查找日常运作上的疲劳风险，并谘询主要渡轮服务营运商，以及利用本地船只谘询委员会的平台作相关讨论。政府表示，会检视本地船只海员的工作环境和情况，并会充分谘询持份者的意见。

其四，向业界发放死因裁判官给予财利船厂的建议。海事处会就此与其他船厂联系。

另外，事故发生以来，政府根据《调查委员会条例》成立事故调查委员会，另由前运输及房屋局领导进行内部调查，以及接纳各项调查的专家报告。政府一直督促海事处努力跟进调查委员会和专家提出的建议，且采取系统性方针，全面落实五大类措施，以加强保障海上安全，避免类似事故发生。

至于涉事海事处职员的责任，前运输及房屋局2014年4月把内部调查报告转交公务员事务局，而公务员事务局已按该报告的建议和律政司的法律意见，根据纪律程序采取行动并完成跟进。此外，两名涉事海事处职员刑事罪名成立，被判入狱。